科学假说的提出

科学假设的结构

在生物医学研究中，科学假说的结构可以表示为C分子→D通路→F功能→X疾病。通过以下步骤进行探究：

1. 筛选分子（相关性研究）：
   C→X
   组织水平：从肿瘤组织样本中筛选出富集基因及其代谢途径和功能。
   临床水平：研究基因表达水平与多种临床指标（如恶性程度、转移情况、耐药性、生存率等）的相关性。
2. 寻找机制（机制研究）：
   C→D
   分子水平：探索相互结合、表达调控、翻译后修饰、降解调控、剪接调控、胞内定位及激酶信号传导等机制。
3. 证实功能（功能研究）：
   C→F
   细胞水平：研究细胞的生长、凋亡、转移、侵润、血管生成以及耐药情况。
   动物水平：评估成肿瘤能力、转移情况及药物敏感性等。

结构的扩展

结构可以进一步扩展为A分子→B分子→C分子→D通路→F功能→X疾病，其中：

• A分子：上游主角。
• C分子：下游主角。研究通常倾向于关注在疾病中上调的“坏”主角分子，这些分子的上调与疾病发生相关，便于作为生物标志物使用。少数情况下也会关注“好”分子，即在疾病中下调的分子，通过干预手段上调这些“好”分子可能有助于改善疾病状况。
• B分子：工具分子。
  1. 通过RNA pull-down法鉴定与RNA结合的工具蛋白（如翻译因子和剪接因子）。
  2. 通过RIP-seq识别与蛋白结合的RNA。
  3. 通过ChIP-seq确认功能蛋白结合的DNA序列（如靶基因）。

单细胞测序背景下的结构创新

C基因→D通路→E细胞亚型→F功能→X疾病的研究模式进一步拓展了科学假说的结构。例如，一项发表在《Nat Immunol》上的研究（2022年10月，doi:10.1038/s41590-022-01312-0）表明，Alox15+巨噬细胞能通过分泌趋化因子招募嗜酸性粒细胞、单核细胞和TH2细胞等风险因素，这在慢性鼻窦炎的发生和发展中起到了重要作用。使用ALOX15抑制剂可有效减轻慢性鼻窦炎中由2型免疫反应过度激活引起的病理损伤。

科学假说的深度

1. 线性结构：A→B→C→D
2. 环形结构：常见于负反馈调控通路。例如，一个生化反应产生了A，并且这种A能够抑制其自身的产生，这便是负反馈调控的经典范例，类似于miRNA的调控机制。