外泌体作为人体天然信息传递的载体,在细胞间的通信中发挥着重要作用。其中,蛋白质是外泌体的重要组成成分,分析外泌体的蛋白质组成对于推动外泌体功能的研究具有重要意义。基于质谱的蛋白质组学技术为这一分析提供了技术支持。通过深入研究外泌体的蛋白质,可以帮助我们理解外泌体及其蛋白质在生命活动中的功能,并识别与疾病相关的生物标志物,为疾病的早期诊断和预后评估提供依据。
尊龙凯时为您提供包括外泌体非标记定量蛋白组学(如DIA、Label-free)和同位素标记定量蛋白组学(如SILAC、iTRAQ、TMT)在内的服务。以下是这些技术的基本原理和应用。
同位素标记定量蛋白组学(SILAC、iTRAQ、TMT)
iTRAQ(isobaric tagging for multiplexed relative and absolute protein quantitation)和TMT(tandem mass tag)是当前广泛应用的蛋白质定量方法之一。这两种方法都是通过化学体外标记来进行定量。由于各自生产商的不同(iTRAQ由ABSciex生产,TMT由ThermoFisher生产),因此它们的标记规格和标签分子结构也有所差异。两者可以检测低丰度的蛋白,包括胞外蛋白、膜蛋白、胞浆蛋白和核蛋白等。同时,它们可以同时处理多个样本,并提供准确的定量结果。
SILAC技术
SILAC(Stable Isotope Labeling by Amino Acids In Cell Culture)是通过培养细胞,利用天然同位素或稳定同位素取代相应的氨基酸。经过多次传代后,稳定同位素会完全掺入新合成的蛋白质中。不同标记的细胞或蛋白质在混合后,通过质谱进行鉴定。如果峰值比为1:1,表示蛋白质含量无差异。如果含有重氨基酸的峰值上升,意味着该组中该蛋白质的含量更高。SILAC的优点在于蛋白标记效率高,灵敏度也较强,能够检测低含量的蛋白质变化和翻译后修饰,且样本需求量小,仅需几十微克。
非标记定量蛋白组学(Label-free)
Label-free蛋白质定量利用液质联用技术对蛋白质进行酶解后形成多肽,再进行质谱分析。通过计算蛋白肽段的鉴定数和色谱峰面积来进行蛋白质的相对定量。该方法的优点是无需额外的标签作为内标,样本准备过程较为简单,能够尽量减少人为及系统误差。然而,数据分析的复杂性相对较高,对设备的稳定性和重复性有较高的要求。
数据非依赖采集(DIA)
DIA(Data Independent Acquisition)是一种近年来备受关注的质谱技术,属于非标记技术。其原理是在质谱数据采集时,以高速的方式对每个采集窗口内的所有母离子及其碎裂后的子离子进行全扫描。这种方法可以高效测定复杂样品中相对低丰度的蛋白质,显著提高定量分析的可靠性。
样本处理与服务流程
尊龙凯时欢迎客户提供各种生物流体样本,如血清、血浆、脑脊液、尿液、胸水、腹水、唾液等体液,以及细胞上清、植物样本和其他特殊样本,也可提供已提取的外泌体。不同样本类型的前处理将根据后续的研究目的和方法进行适当调整。
综上所述,尊龙凯时致力于为外泌体研究提供高效的质谱技术支持,助力生物医疗领域的创新与发展,推动外泌体及其相关生物标志物的研究进程。